UPF1/RENT1 Lapin pAb - Q92900

Spécifications et paramètres clés du produit

Contexte biologique : Fonction et localisation de l'UPF1/RENT1

• UPF1 (Régulateur des transcripts non-sens 1), également connu sous le nom de RENT1 ou hUpf1, est une hélicase ARN dépendante de l'ATP et le régulateur principal de la dégradation de l'ARNm médiée par les codons non-sens (NMD), une voie de surveillance qui dégrade les ARNm contenant des codons d'arrêt prématurés. Références associées : PMID:11163187 PMID:16086026 PMID:18172165

• L'enzyme catalyse le déroulement dépendant de l'ATP des duplex ADN:ARN, ARN:ARN et ADN:ADN dans la direction 5'-3', l'ADN simple brin stimulant fortement son activité ATPase. Références associées : PMID:10999600 PMID:18066079 PMID:21419344 PMID:23275559 PMID:26138914 PMID:30218034

• Lors de l'arrêt de la traduction, l'UPF1 est recruté vers les ribosomes bloqués et alterne entre des états phosphorylés et déphosphorylés ; sa phosphorylation par SMG1 est un interrupteur critique qui déclenche le NMD. Références associées : PMID:11544179 PMID:19417104 PMID:25220460

• Dans la voie canonique dépendante du complexe de jonction d'exon (EJC), l'UPF1 s'assemble en un hétérotrimère complexe SURF, puis avec UPF2/UPF3 pour former le complexe de surveillance actif, qui dirige les ARNm cibles vers une dégradation exonucléolytique et endonucléolytique. Références associées : PMID:21419344 PMID:12554878

• L'UPF1 fonctionne également dans des voies NMD alternatives indépendamment d'UPF2/UPF3 et médie la dégradation de l'ARNm des histones dépendante de la réplication à la fin de la phase S. Références associées : PMID:16086026 PMID:18172165 PMID:18447585

• La protéine se localise dans le cytoplasme, les corps de traitement (P-bodies), le noyau et la région périnucléaire.

• L'UPF1 est exprimé de manière ubiquitaire, contient des domaines à doigts de zinc et fait l'objet de modifications post-traductionnelles, notamment la phosphorylation, la méthylation et l'isomérisation.

Conseils expérimentaux et astuces techniques

• Comme l'immunogène correspond à la région C-terminale (aa 819–1118), on s'attend à ce que l'anticorps reconnaisse tous les isoformes d'UPF1 et convienne pour détecter les variantes de pleine longueur et tronquées en WB et IP.
• Pour le western blot, le poids moléculaire prédit est d'environ 124 kDa ; utilisez des conditions réductrices et validez avec des témoins positifs (par exemple, HeLa, HEK293) et négatifs appropriés.
• En immunofluorescence/ICC, l'UPF1 présente généralement un motif cytoplasmique diffus et nucléaire ponctué ; les conditions de perméabilisation peuvent nécessiter une optimisation.
• La réactivité croisée signalée avec la souris et le rat rend cet anticorps utile pour les études sur des modèles rongeurs, mais une validation dans le système d'échantillons spécifique est recommandée.
• Pour les applications ELISA et IP, la nature polyclonale peut offrir une sensibilité élevée, bien qu'une titration et une optimisation du blocage soient conseillées.

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