[KD validé] Anticorps monoclonal anti-YTHDC1 pour WB, IHC-P, IP, ELISA - Q96MU7

Spécifications et paramètres essentiels du produit

Contexte biologique : fonction et localisation de YTHDC1

• La protéine 1 contenant le domaine YTH (YTHDC1), également connue sous les noms YT521-B ou facteur d’épissage YT521, appartient à la famille des protéines de liaison à l’ARN contenant un domaine YTH, qui reconnaissent spécifiquement les ARN modifiés par la N6-méthyladénosine (m6A). Références associées : PMID:25242552, PMID:26318451, PMID:26876937

• YTHDC1 agit comme un régulateur clé de l’épissage alternatif : il se lie aux pré-ARNm contenant de la m6A et recrute des facteurs d’épissage. Son interaction avec SRSF3 favorise l’inclusion des exons, tandis que sa compétition avec SRSF10 entraîne l’inhibition de l’exclusion des exons. Référence associée : PMID:26876937

• Il joue également un rôle dans l’export nucléaire des ARNm modifiés par la m6A, en se liant simultanément à SRSF3 et au facteur d’export nucléaire NXF1, facilitant ainsi le transport des ARNm du noyau vers le cytoplasme. Référence associée : PMID:28984244

• YTHDC1 participe à la régulation de l’inactivation du chromosome X en reconnaissant la m6A sur l’ARN Xist et en favorisant son activité de répression transcriptionnelle, contribuant ainsi à l’extinction de l’un des chromosomes X chez les mammifères femelles. Référence associée : PMID:27602518

• Au-delà de l’ARN, YTHDC1 peut également se lier à l’ADN simple brin contenant de la m6A, ce qui suggère des fonctions plus larges dans les processus médiés par les acides nucléiques. Référence associée : PMID:32663306

• Au niveau subcellulaire, YTHDC1 se localise principalement dans le noyau et s’enrichit dans les speckles nucléaires, qui constituent des sites de stockage et de modification des facteurs d’épissage, ce qui concorde avec son rôle dans le traitement des pré-ARNm.

• Les modifications post-traductionnelles comprennent la phosphorylation et l’ubiquitination (formation de liaisons isopeptidiques), qui peuvent réguler son activité et sa stabilité. La protéine possède un poids moléculaire prédit de 84,7 kDa, avec une bande observée à environ 85 kDa par western blot.

• YTHDC1 est essentiel au développement de la lignée germinale. Des études menées sur des organismes modèles ont montré qu’il est nécessaire au développement des spermatogonies chez les mâles et à la croissance des ovocytes chez les femelles, probablement par l’intermédiaire de ses fonctions d’épissage alternatif.

Conseils expérimentaux et recommandations techniques

• L’immunogène correspond aux 71 acides aminés N-terminaux de YTHDC1 humain. Comme l’épitope se situe dans une région commune à plusieurs variants d’épissage, l’anticorps peut détecter plusieurs isoformes ; une validation dans la lignée cellulaire ou le tissu concerné est recommandée.
• L’analyse par western blot avec cet anticorps devrait révéler une bande proche de 85 kDa. Des lysats de cellules humaines, de souris ou de rat peuvent être utilisés, mais le profil exact des bandes doit être confirmé dans les conditions expérimentales employées.
• Pour l’immunohistochimie (IHC-P), un signal principalement nucléaire, souvent concentré dans les speckles nucléaires, est attendu. Une optimisation de la récupération antigénique et de la dilution de l’anticorps peut être nécessaire pour chaque type de tissu.
• L’anticorps convient à l’immunoprécipitation (IP) de YTHDC1 endogène ; la co-immunoprécipitation de partenaires interacteurs tels que SRSF3 peut être étudiée avec des contrôles appropriés.
• Les applications ELISA peuvent être développées en utilisant cet anticorps comme réactif de capture ou de détection ; pour les formats ELISA sandwich, il est conseillé de l’associer à un anticorps polyclonal de détection ou à une paire d’anticorps appariés.
• La validation par extinction (KD) confirme que le signal est réduit après la déplétion de YTHDC1, ce qui étaye sa spécificité pour l’identification de la cible dans les études d’extinction génique.

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