Anticorps monoclonal anti-UAP56/DDX39B pour WB, IHC-P, ELISA - Q13838

Spécifications et paramètres principaux du produit

Contexte biologique : fonction et localisation de UAP56/DDX39B

• L’hélicase à ARN du spliceosome DDX39B, également connue sous les noms de protéine associée à U2AF65 de 56 kDa, hélicase à ARN p47 dépendante de l’ATP, protéine DEAD box UAP56 et protéine 1 du transcrit associé à HLA-B, est codée par le gène DDX39B (BAT1, UAP56).
• Composant du complexe TREX, couplant la transcription, la maturation et l’exportation nucléaire des ARNm. S’associe spécifiquement aux ARNm épissés et est recrutée de manière dépendante de l’épissage et de la coiffe près de l’extrémité 5′, jouant un rôle dans l’exportation des ARNm via la voie TAP/NXF1. Participe également à l’exportation nucléaire des ARNm non épissés. Références associées : PMID:15833825 PMID:15998806 PMID:17190602
• Nécessaire à la première étape dépendante de l’ATP de l’assemblage du spliceosome et à l’interaction du snRNP U2 avec le point de branchement. Présente des activités de liaison et d’hydrolyse de l’ATP stimulées par l’ARN ainsi que de déroulement de l’ARN dépendante de l’ATP ; les activités d’hélicase et d’ATPase ne sont pas influencées par U2AF2, bien qu’un effet stimulant d’ALYREF/THOC4 ait été rapporté (PMID:23299939). Références associées : PMID:23299939
• S’associe à SARNP/CIP29, qui facilite la liaison de l’ARN par DDX39B et joue probablement un rôle dans l’exportation des ARNm. Références associées : PMID:37578863
• Joue un rôle dans l’exportation des ARNm dépourvus d’introns ; le complexe TREX est essentiel à l’exportation des ARNm dépourvus d’introns du virus associé au sarcome de Kaposi (KSHV) et à la production de virus infectieux.
• La localisation subcellulaire est principalement nucléaire, avec une présence dans les speckles nucléaires ; la protéine est également détectable dans le cytoplasme.
• Les modifications post-traductionnelles comprennent l’acétylation, la phosphorylation et l’ubiquitination (formation de liaisons isopeptidiques), comme l’indiquent les analyses protéomiques.
• Appartient à la famille des hélicases DEAD box ; motifs clés : liaison à l’ATP, liaison aux nucléotides et liaison à l’ARN. Participe à la maturation des ARNm, à l’épissage des ARNm, au transport des ARNm et à la stabilité du génome.

Conseils expérimentaux et recommandations techniques

• L’immunogène couvre la région C-terminale (acides aminés 310-428), qui est conservée chez l’humain, la souris et le rat ; confirmer l’homologie de séquence pour les autres espèces si nécessaire.
• Pour le western blot, le poids moléculaire prévu est de 49 kDa ; valider avec des contrôles positifs et négatifs appropriés dans votre système d’échantillonnage.
• Pour l’IHC-P, envisager une récupération antigénique et optimiser la dilution de l’anticorps primaire en fonction du type de tissu ; valider dans des tissus connus pour exprimer UAP56/DDX39B.
• Pour l’ELISA, utiliser une protéine recombinante comme standard et ajuster la concentration d’anticorps afin d’obtenir un rapport signal/bruit optimal.
• L’anticorps est recommandé pour la recherche sur la maturation, l’épissage et l’exportation nucléaire des ARNm ; les performances peuvent varier selon les applications.

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